Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP20293 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP20293 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP20293 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP20293 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TP20293 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TP20293 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TP20293 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TP20293 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP20293 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP20293 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP20293 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP20293 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP20293 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP20293 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TP20293 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP20293 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP20293 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP20293 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP20293 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP20293 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP20293 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP20293 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TP20293 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TP20293 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TP20293 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TP20293 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TP20293 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TP20293 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TP20293 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TP20293 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TP20293 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TP20293 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TP20293 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TP20293 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TP20293 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TP20293 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TP20293 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TP20293 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TP20293 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TP20293 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TP20293 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TP20293 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TP20293 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TP20293 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TP20293 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TP20293 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TP20293 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TP20293 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TP20293 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TP20293 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TP20293 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TP20293 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TP20293 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TP20293 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TP20293 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TP20293 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TP20293 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TP20293 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TP20293 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TP20293 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TP20293 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TP20293 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TP20293 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TP20293 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TP20293 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TP20293 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TP20293 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TP20293 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TP20293 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TP20293 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TP20293 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TP20293 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TP20293 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TP20293 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TP20293 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TP20293 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TP20293 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TP20293 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TP20293 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TP20293 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TP20293 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TP20293 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TP20293 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TP20293 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TP20293 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TP20293 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TP20293 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TP20293 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TP20293 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TP20293 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TP20293 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TP20293 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TP20293 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TP20293 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TP20293 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TP20293 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TP20293 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TP20293 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TP20293 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms