Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cox5bP19536 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox5bP19536 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox5bP19536 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox5bP19536 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms