Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NefhP19246 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NefhP19246 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NefhP19246 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NefhP19246 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NefhP19246 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NefhP19246 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NefhP19246 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NefhP19246 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NefhP19246 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NefhP19246 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NefhP19246 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NefhP19246 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NefhP19246 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NefhP19246 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NefhP19246 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NefhP19246 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NefhP19246 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NefhP19246 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NefhP19246 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NefhP19246 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NefhP19246 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NefhP19246 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NefhP19246 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NefhP19246 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NefhP19246 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NefhP19246 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NefhP19246 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NefhP19246 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NefhP19246 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NefhP19246 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NefhP19246 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NefhP19246 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NefhP19246 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NefhP19246 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NefhP19246 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NefhP19246 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NefhP19246 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NefhP19246 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NefhP19246 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NefhP19246 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NefhP19246 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NefhP19246 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NefhP19246 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NefhP19246 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NefhP19246 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NefhP19246 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NefhP19246 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NefhP19246 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NefhP19246 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NefhP19246 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NefhP19246 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NefhP19246 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NefhP19246 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NefhP19246 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NefhP19246 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NefhP19246 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NefhP19246 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NefhP19246 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NefhP19246 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NefhP19246 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NefhP19246 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NefhP19246 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NefhP19246 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NefhP19246 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NefhP19246 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NefhP19246 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NefhP19246 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NefhP19246 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NefhP19246 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NefhP19246 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NefhP19246 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NefhP19246 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NefhP19246 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NefhP19246 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NefhP19246 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NefhP19246 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NefhP19246 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NefhP19246 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NefhP19246 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NefhP19246 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NefhP19246 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NefhP19246 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NefhP19246 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NefhP19246 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NefhP19246 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NefhP19246 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NefhP19246 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NefhP19246 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NefhP19246 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NefhP19246 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NefhP19246 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NefhP19246 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NefhP19246 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NefhP19246 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NefhP19246 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NefhP19246 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NefhP19246 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NefhP19246 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NefhP19246 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms