Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtpraP18052 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtpraP18052 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtpraP18052 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtpraP18052 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PtpraP18052 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PtpraP18052 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtpraP18052 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtpraP18052 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms