Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata1P17679 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata1P17679 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata1P17679 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata1P17679 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata1P17679 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gata1P17679 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gata1P17679 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gata1P17679 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gata1P17679 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gata1P17679 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gata1P17679 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gata1P17679 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gata1P17679 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata1P17679 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata1P17679 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata1P17679 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata1P17679 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata1P17679 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata1P17679 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata1P17679 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata1P17679 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata1P17679 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata1P17679 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata1P17679 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata1P17679 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata1P17679 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata1P17679 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata1P17679 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata1P17679 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata1P17679 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata1P17679 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata1P17679 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata1P17679 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata1P17679 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata1P17679 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gata1P17679 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms