Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sptan1P16546 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms