Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SptbP15508 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SptbP15508 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SptbP15508 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SptbP15508 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SptbP15508 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SptbP15508 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SptbP15508 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SptbP15508 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SptbP15508 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SptbP15508 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SptbP15508 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SptbP15508 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SptbP15508 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SptbP15508 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SptbP15508 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SptbP15508 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SptbP15508 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SptbP15508 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SptbP15508 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SptbP15508 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SptbP15508 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SptbP15508 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SptbP15508 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SptbP15508 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SptbP15508 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SptbP15508 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SptbP15508 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SptbP15508 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SptbP15508 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SptbP15508 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SptbP15508 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SptbP15508 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SptbP15508 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SptbP15508 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SptbP15508 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SptbP15508 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SptbP15508 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SptbP15508 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SptbP15508 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SptbP15508 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SptbP15508 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SptbP15508 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SptbP15508 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SptbP15508 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SptbP15508 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SptbP15508 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SptbP15508 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SptbP15508 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SptbP15508 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SptbP15508 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SptbP15508 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SptbP15508 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SptbP15508 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SptbP15508 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SptbP15508 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SptbP15508 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SptbP15508 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SptbP15508 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SptbP15508 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SptbP15508 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SptbP15508 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SptbP15508 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SptbP15508 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SptbP15508 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SptbP15508 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SptbP15508 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SptbP15508 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SptbP15508 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SptbP15508 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SptbP15508 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SptbP15508 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SptbP15508 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SptbP15508 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SptbP15508 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SptbP15508 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SptbP15508 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SptbP15508 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SptbP15508 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SptbP15508 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SptbP15508 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SptbP15508 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SptbP15508 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SptbP15508 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SptbP15508 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SptbP15508 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SptbP15508 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SptbP15508 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SptbP15508 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SptbP15508 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SptbP15508 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SptbP15508 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SptbP15508 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SptbP15508 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SptbP15508 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SptbP15508 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SptbP15508 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SptbP15508 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SptbP15508 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SptbP15508 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms