Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf1P15314 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf1P15314 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf1P15314 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf1P15314 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf1P15314 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf1P15314 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf1P15314 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf1P15314 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf1P15314 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf1P15314 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf1P15314 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf1P15314 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms