Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmnb1P14733 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms