Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Dnmt1P13864 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Dnmt1P13864 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Dnmt1P13864 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Dnmt1P13864 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Dnmt1P13864 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Dnmt1P13864 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Dnmt1P13864 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Dnmt1P13864 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Dnmt1P13864 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dnmt1P13864 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dnmt1P13864 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dnmt1P13864 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dnmt1P13864 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dnmt1P13864 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dnmt1P13864 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Dnmt1P13864 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dnmt1P13864 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Dnmt1P13864 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Dnmt1P13864 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Dnmt1P13864 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dnmt1P13864 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dnmt1P13864 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dnmt1P13864 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dnmt1P13864 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dnmt1P13864 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dnmt1P13864 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Dnmt1P13864 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms