Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb1P13372 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms