Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrm1P12657 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrm1P12657 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrm1P12657 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrm1P12657 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrm1P12657 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrm1P12657 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrm1P12657 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrm1P12657 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrm1P12657 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrm1P12657 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrm1P12657 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrm1P12657 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrm1P12657 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrm1P12657 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrm1P12657 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrm1P12657 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrm1P12657 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrm1P12657 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrm1P12657 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrm1P12657 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Chrm1P12657 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Chrm1P12657 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chrm1P12657 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chrm1P12657 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chrm1P12657 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms