Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt8P11679 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt8P11679 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt8P11679 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt8P11679 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt8P11679 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt8P11679 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt8P11679 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt8P11679 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt8P11679 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt8P11679 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt8P11679 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt8P11679 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms