Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PolP11369 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PolP11369 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PolP11369 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PolP11369 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PolP11369 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PolP11369 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PolP11369 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PolP11369 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PolP11369 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PolP11369 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PolP11369 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PolP11369 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PolP11369 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PolP11369 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PolP11369 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PolP11369 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PolP11369 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PolP11369 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PolP11369 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PolP11369 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PolP11369 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PolP11369 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PolP11369 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PolP11369 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PolP11369 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PolP11369 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PolP11369 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PolP11369 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PolP11369 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PolP11369 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PolP11369 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PolP11369 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PolP11369 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PolP11369 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PolP11369 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PolP11369 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PolP11369 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PolP11369 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PolP11369 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PolP11369 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PolP11369 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PolP11369 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PolP11369 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PolP11369 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PolP11369 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PolP11369 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PolP11369 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PolP11369 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PolP11369 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PolP11369 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PolP11369 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PolP11369 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PolP11369 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PolP11369 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PolP11369 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PolP11369 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PolP11369 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PolP11369 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PolP11369 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PolP11369 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PolP11369 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PolP11369 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PolP11369 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PolP11369 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PolP11369 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PolP11369 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PolP11369 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PolP11369 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PolP11369 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PolP11369 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PolP11369 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PolP11369 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PolP11369 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PolP11369 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PolP11369 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PolP11369 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PolP11369 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PolP11369 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PolP11369 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PolP11369 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PolP11369 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PolP11369 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PolP11369 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PolP11369 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PolP11369 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PolP11369 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PolP11369 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PolP11369 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PolP11369 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PolP11369 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PolP11369 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PolP11369 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PolP11369 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PolP11369 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PolP11369 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PolP11369 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PolP11369 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PolP11369 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PolP11369 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms