Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FlgP11088 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FlgP11088 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FlgP11088 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FlgP11088 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FlgP11088 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FlgP11088 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FlgP11088 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FlgP11088 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FlgP11088 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FlgP11088 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FlgP11088 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FlgP11088 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FlgP11088 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FlgP11088 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FlgP11088 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FlgP11088 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FlgP11088 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FlgP11088 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FlgP11088 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FlgP11088 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FlgP11088 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FlgP11088 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FlgP11088 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
FlgP11088 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
FlgP11088 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FlgP11088 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FlgP11088 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FlgP11088 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FlgP11088 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FlgP11088 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FlgP11088 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FlgP11088 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FlgP11088 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FlgP11088 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FlgP11088 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FlgP11088 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FlgP11088 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FlgP11088 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FlgP11088 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FlgP11088 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FlgP11088 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FlgP11088 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FlgP11088 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FlgP11088 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FlgP11088 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FlgP11088 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FlgP11088 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FlgP11088 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FlgP11088 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FlgP11088 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FlgP11088 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FlgP11088 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FlgP11088 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FlgP11088 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FlgP11088 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FlgP11088 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FlgP11088 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FlgP11088 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FlgP11088 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FlgP11088 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FlgP11088 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FlgP11088 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
FlgP11088 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FlgP11088 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FlgP11088 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FlgP11088 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FlgP11088 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FlgP11088 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FlgP11088 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FlgP11088 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FlgP11088 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FlgP11088 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FlgP11088 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FlgP11088 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FlgP11088 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FlgP11088 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FlgP11088 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FlgP11088 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FlgP11088 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FlgP11088 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FlgP11088 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FlgP11088 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FlgP11088 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
FlgP11088 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FlgP11088 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FlgP11088 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FlgP11088 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FlgP11088 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FlgP11088 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FlgP11088 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FlgP11088 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FlgP11088 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FlgP11088 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FlgP11088 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FlgP11088 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FlgP11088 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FlgP11088 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FlgP11088 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FlgP11088 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms