Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dnmt3cP0DOY1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnmt3cP0DOY1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnmt3cP0DOY1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnmt3cP0DOY1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnmt3cP0DOY1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnmt3cP0DOY1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnmt3cP0DOY1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnmt3cP0DOY1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnmt3cP0DOY1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnmt3cP0DOY1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnmt3cP0DOY1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnmt3cP0DOY1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnmt3cP0DOY1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnmt3cP0DOY1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnmt3cP0DOY1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms