Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb1P09055 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms