Protein–RNA interactions for Protein: O88838

Spsb2, SPRY domain-containing SOCS box protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb2O88838 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms