Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BlmO88700 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BlmO88700 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BlmO88700 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BlmO88700 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BlmO88700 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BlmO88700 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
BlmO88700 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
BlmO88700 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BlmO88700 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BlmO88700 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BlmO88700 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BlmO88700 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BlmO88700 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
BlmO88700 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
BlmO88700 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
BlmO88700 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
BlmO88700 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BlmO88700 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
BlmO88700 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BlmO88700 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BlmO88700 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BlmO88700 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
BlmO88700 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BlmO88700 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BlmO88700 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BlmO88700 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BlmO88700 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BlmO88700 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BlmO88700 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BlmO88700 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BlmO88700 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BlmO88700 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BlmO88700 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BlmO88700 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BlmO88700 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BlmO88700 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BlmO88700 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BlmO88700 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BlmO88700 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BlmO88700 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BlmO88700 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BlmO88700 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BlmO88700 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BlmO88700 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BlmO88700 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BlmO88700 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BlmO88700 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BlmO88700 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BlmO88700 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BlmO88700 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BlmO88700 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BlmO88700 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BlmO88700 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BlmO88700 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BlmO88700 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BlmO88700 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BlmO88700 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BlmO88700 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BlmO88700 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BlmO88700 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BlmO88700 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BlmO88700 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
BlmO88700 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BlmO88700 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BlmO88700 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BlmO88700 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BlmO88700 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BlmO88700 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BlmO88700 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BlmO88700 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BlmO88700 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BlmO88700 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BlmO88700 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BlmO88700 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BlmO88700 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BlmO88700 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BlmO88700 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BlmO88700 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
BlmO88700 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BlmO88700 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BlmO88700 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BlmO88700 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BlmO88700 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
BlmO88700 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BlmO88700 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BlmO88700 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BlmO88700 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BlmO88700 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
BlmO88700 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
BlmO88700 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BlmO88700 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BlmO88700 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BlmO88700 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BlmO88700 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BlmO88700 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BlmO88700 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BlmO88700 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BlmO88700 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BlmO88700 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms