Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Itgb5O70309 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms