Protein–RNA interactions for Protein: O70137

Alx3, Homeobox protein aristaless-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx3O70137 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Alx3O70137 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx3O70137 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx3O70137 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx3O70137 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx3O70137 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx3O70137 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx3O70137 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx3O70137 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms