Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms