Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrxO55103 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrxO55103 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrxO55103 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrxO55103 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrxO55103 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrxO55103 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrxO55103 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrxO55103 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrxO55103 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrxO55103 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrxO55103 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrxO55103 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrxO55103 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrxO55103 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PrxO55103 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrxO55103 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrxO55103 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrxO55103 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrxO55103 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrxO55103 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrxO55103 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrxO55103 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrxO55103 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrxO55103 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrxO55103 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrxO55103 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrxO55103 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PrxO55103 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrxO55103 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrxO55103 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrxO55103 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrxO55103 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrxO55103 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrxO55103 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrxO55103 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrxO55103 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrxO55103 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrxO55103 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PrxO55103 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PrxO55103 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PrxO55103 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrxO55103 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrxO55103 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PrxO55103 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrxO55103 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
PrxO55103 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrxO55103 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrxO55103 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrxO55103 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrxO55103 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrxO55103 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrxO55103 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrxO55103 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrxO55103 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrxO55103 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrxO55103 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrxO55103 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrxO55103 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrxO55103 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrxO55103 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrxO55103 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrxO55103 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrxO55103 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrxO55103 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrxO55103 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrxO55103 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrxO55103 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrxO55103 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrxO55103 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrxO55103 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrxO55103 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrxO55103 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrxO55103 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PrxO55103 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrxO55103 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PrxO55103 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrxO55103 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrxO55103 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrxO55103 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrxO55103 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrxO55103 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrxO55103 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrxO55103 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrxO55103 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrxO55103 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrxO55103 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrxO55103 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrxO55103 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PrxO55103 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrxO55103 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrxO55103 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrxO55103 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrxO55103 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrxO55103 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrxO55103 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrxO55103 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrxO55103 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrxO55103 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PrxO55103 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms