Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Csnk2a2O54833 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms