Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Edil3O35474 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Edil3O35474 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edil3O35474 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Edil3O35474 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edil3O35474 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edil3O35474 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edil3O35474 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edil3O35474 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edil3O35474 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms