Protein–RNA interactions for Protein: O35448

Ppt2, Lysosomal thioesterase PPT2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppt2O35448 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppt2O35448 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppt2O35448 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppt2O35448 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppt2O35448 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppt2O35448 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppt2O35448 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppt2O35448 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppt2O35448 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms