Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms