Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms