Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcns1O35173 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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