Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap23O09044 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap23O09044 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snap23O09044 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snap23O09044 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap23O09044 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snap23O09044 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snap23O09044 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snap23O09044 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Snap23O09044 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snap23O09044 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snap23O09044 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snap23O09044 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snap23O09044 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snap23O09044 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Snap23O09044 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snap23O09044 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snap23O09044 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snap23O09044 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snap23O09044 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snap23O09044 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snap23O09044 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snap23O09044 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snap23O09044 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snap23O09044 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snap23O09044 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snap23O09044 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms