Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckarO08786 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckarO08786 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckarO08786 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckarO08786 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckarO08786 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckarO08786 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckarO08786 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckarO08786 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckarO08786 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckarO08786 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckarO08786 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckarO08786 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckarO08786 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CckarO08786 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CckarO08786 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CckarO08786 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CckarO08786 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CckarO08786 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CckarO08786 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CckarO08786 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CckarO08786 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CckarO08786 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CckarO08786 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CckarO08786 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CckarO08786 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CckarO08786 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CckarO08786 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CckarO08786 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CckarO08786 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CckarO08786 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckarO08786 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckarO08786 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckarO08786 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckarO08786 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckarO08786 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckarO08786 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckarO08786 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckarO08786 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckarO08786 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckarO08786 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckarO08786 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CckarO08786 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckarO08786 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckarO08786 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckarO08786 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckarO08786 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckarO08786 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckarO08786 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckarO08786 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckarO08786 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckarO08786 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckarO08786 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckarO08786 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckarO08786 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckarO08786 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckarO08786 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckarO08786 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CckarO08786 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckarO08786 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckarO08786 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckarO08786 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckarO08786 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckarO08786 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckarO08786 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckarO08786 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckarO08786 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckarO08786 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckarO08786 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckarO08786 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CckarO08786 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckarO08786 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckarO08786 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckarO08786 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckarO08786 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckarO08786 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckarO08786 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckarO08786 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckarO08786 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckarO08786 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckarO08786 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckarO08786 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckarO08786 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CckarO08786 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckarO08786 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CckarO08786 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckarO08786 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckarO08786 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckarO08786 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckarO08786 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckarO08786 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckarO08786 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckarO08786 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckarO08786 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckarO08786 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckarO08786 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckarO08786 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckarO08786 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckarO08786 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckarO08786 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms