Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20878L7N244 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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