Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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