Protein–RNA interactions for Protein: J3QPA5

Gm3099, Predicted gene 3099, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3099J3QPA5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3099J3QPA5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms