Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shisa8J3QNX5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms