Protein–RNA interactions for Protein: J3QNV7

Gm10428, Predicted gene 10428, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10428J3QNV7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms