Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ccdc180J3QNE4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ccdc180J3QNE4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ccdc180J3QNE4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ccdc180J3QNE4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccdc180J3QNE4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccdc180J3QNE4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccdc180J3QNE4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccdc180J3QNE4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccdc180J3QNE4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccdc180J3QNE4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccdc180J3QNE4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Ccdc180J3QNE4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ccdc180J3QNE4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ccdc180J3QNE4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ccdc180J3QNE4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ccdc180J3QNE4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ccdc180J3QNE4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ccdc180J3QNE4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ccdc180J3QNE4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ccdc180J3QNE4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ccdc180J3QNE4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ccdc180J3QNE4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ccdc180J3QNE4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ccdc180J3QNE4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ccdc180J3QNE4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ccdc180J3QNE4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms