Protein–RNA interactions for Protein: J3QMW1

Gm7137, MCG1044197, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7137J3QMW1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gm7137J3QMW1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm7137J3QMW1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm7137J3QMW1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm7137J3QMW1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm7137J3QMW1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm7137J3QMW1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm7137J3QMW1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm7137J3QMW1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm7137J3QMW1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm7137J3QMW1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm7137J3QMW1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7137J3QMW1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7137J3QMW1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7137J3QMW1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7137J3QMW1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7137J3QMW1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7137J3QMW1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm7137J3QMW1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7137J3QMW1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7137J3QMW1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7137J3QMW1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7137J3QMW1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm7137J3QMW1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7137J3QMW1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7137J3QMW1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7137J3QMW1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7137J3QMW1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7137J3QMW1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7137J3QMW1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7137J3QMW1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7137J3QMW1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7137J3QMW1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7137J3QMW1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7137J3QMW1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm7137J3QMW1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm7137J3QMW1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7137J3QMW1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm7137J3QMW1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7137J3QMW1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm7137J3QMW1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm7137J3QMW1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm7137J3QMW1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm7137J3QMW1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm7137J3QMW1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm7137J3QMW1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm7137J3QMW1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm7137J3QMW1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm7137J3QMW1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm7137J3QMW1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm7137J3QMW1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm7137J3QMW1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm7137J3QMW1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm7137J3QMW1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm7137J3QMW1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm7137J3QMW1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm7137J3QMW1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm7137J3QMW1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm7137J3QMW1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm7137J3QMW1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm7137J3QMW1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm7137J3QMW1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm7137J3QMW1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm7137J3QMW1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm7137J3QMW1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm7137J3QMW1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm7137J3QMW1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm7137J3QMW1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm7137J3QMW1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm7137J3QMW1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm7137J3QMW1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm7137J3QMW1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms