Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20834J3QM72 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20834J3QM72 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms