Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pot1bH7BX60 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms