Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm29394H3BIW7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm29394H3BIW7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm29394H3BIW7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms