Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tubgcp6G5E8P0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms