Protein–RNA interactions for Protein: G5E870

Trip12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip12G5E870 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip12G5E870 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip12G5E870 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip12G5E870 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip12G5E870 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip12G5E870 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip12G5E870 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip12G5E870 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip12G5E870 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip12G5E870 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip12G5E870 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms