Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Colca2F8VPY8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms