Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3371F7CQW8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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