Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm28048F7BCN0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms