Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8220F6YKI2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8220F6YKI2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8220F6YKI2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8220F6YKI2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8220F6YKI2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8220F6YKI2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8220F6YKI2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8220F6YKI2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8220F6YKI2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8220F6YKI2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8220F6YKI2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8220F6YKI2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8220F6YKI2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8220F6YKI2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8220F6YKI2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8220F6YKI2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8220F6YKI2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8220F6YKI2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8220F6YKI2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8220F6YKI2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8220F6YKI2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8220F6YKI2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8220F6YKI2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8220F6YKI2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8220F6YKI2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8220F6YKI2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8220F6YKI2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms