Protein–RNA interactions for Protein: F6W8I0

Yjefn3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yjefn3F6W8I0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yjefn3F6W8I0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yjefn3F6W8I0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yjefn3F6W8I0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yjefn3F6W8I0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Yjefn3F6W8I0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Yjefn3F6W8I0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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