Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf165E9QAU8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rnf165E9QAU8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rnf165E9QAU8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rnf165E9QAU8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf165E9QAU8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf165E9QAU8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf165E9QAU8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf165E9QAU8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf165E9QAU8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf165E9QAU8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf165E9QAU8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf165E9QAU8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf165E9QAU8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf165E9QAU8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf165E9QAU8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf165E9QAU8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf165E9QAU8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms