Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cald1E9QA15 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cald1E9QA15 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cald1E9QA15 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms